Python处理PDF与CDF实例
在拿到数据后,最需要做的工作之一就是查看一下自己的数据分布情况。而针对数据的分布,又包括pdf和cdf两类。
下面介绍使用python生成pdf的方法:
使用matplotlib的画图接口hist(),直接画出pdf分布;
使用numpy的数据处理函数histogram(),可以生成pdf分布数据,方便进行后续的数据处理,比如进一步生成cdf;
使用seaborn的distplot(),好处是可以进行pdf分布的拟合,查看自己数据的分布类型;
上图所示为采用3种算法生成的pdf图。下面是源代码。
from scipy import stats
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns
arr = np.random.normal(size=100)
# plot histogram
plt.subplot(221)
plt.hist(arr)
# obtain histogram data
plt.subplot(222)
hist, bin_edges = np.histogram(arr)
plt.plot(hist)
# fit histogram curve
plt.subplot(223)
sns.distplot(arr, kde=False, fit=stats.gamma, rug=True)
plt.show()
下面介绍使用python生成cdf的方法:
使用numpy的数据处理函数histogram(),生成pdf分布数据,进一步生成cdf;
使用seaborn的cumfreq(),直接画出cdf;
上图所示为采用2种算法生成的cdf图。下面是源代码。
from scipy import stats
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns
arr = np.random.normal(size=100)
plt.subplot(121)
hist, bin_edges = np.histogram(arr)
cdf = np.cumsum(hist)
plt.plot(cdf)
plt.subplot(122)
cdf = stats.cumfreq(arr)
plt.plot(cdf[0])
plt.show()
在更多时候,需要把pdf和cdf放在一起,可以更好的显示数据分布。这个实现需要把pdf和cdf分别进行归一化。
上图所示为归一化的pdf和cdf。下面是源代码。
from scipy import stats
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import seaborn as sns
arr = np.random.normal(size=100)
hist, bin_edges = np.histogram(arr)
width = (bin_edges[1] - bin_edges[0]) * 0.8
plt.bar(bin_edges[1:], hist/max(hist), width=width, color='#5B9BD5')
cdf = np.cumsum(hist/sum(hist))
plt.plot(bin_edges[1:], cdf, '-*', color='#ED7D31')
plt.xlim([-2, 2])
plt.ylim([0, 1])
plt.grid()
plt.show()
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