pandas高级操作

pandas有些功能很逆天,但却鲜为人知,本篇给大家盘点一下。

一、ACCESSOR

pandas有一种功能非常强大的方法,它就是accessor,可以将它理解为一种属性接口,通过它可以获得额外的方法。其实这样说还是很笼统,下面我们通过代码和实例来理解一下。

>>> pd.Series._accessors  

{'cat', 'str', 'dt'}

对于Series数据结构使用_accessors方法,可以得到了3个对象:cat,str,dt。

  • .cat:用于分类数据(Categorical data)
  • .str:用于字符数据(String Object data)
  • .dt:用于时间数据(datetime-like data)

下面我们依次看一下这三个对象是如何使用的。

str对象的使用

Series数据类型:str字符串

 定义一个Series序列

>>> addr = pd.Series([  

...     'Washington, D.C. 20003',

...     'Brooklyn, NY 11211-1755',

...     'Omaha, NE 68154',

...     'Pittsburgh, PA 15211'

... ]) 

>>> addr.str.upper()

0     WASHINGTON, D.C. 20003

1    BROOKLYN, NY 11211-1755

2            OMAHA, NE 68154

3       PITTSBURGH, PA 15211

dtype: object

>>> addr.str.count(r'\d') 

0    5

1    9

2    5

3    5

dtype: int64

关于以上str对象的2个方法说明:

  • Series.str.upper:将Series中所有字符串变为大写
  • Series.str.count:对Series中所有字符串的个数进行计数

其实不难发现,该用法的使用与Python中字符串的操作很相似。没错,在pandas中你一样可以这样简单的操作,而不同的是你操作的是一整列的字符串数据。仍然基于以上数据集,再看它的另一个操作:

>>> regex = (r'(?P<city>[A-Za-z ]+), '      # 一个或更多字母  

...          r'(?P<state>[A-Z]{2}) '        # 两个大写字母

...          r'(?P<zip>\d{5}(?:-\d{4})?)')  # 可选的4个延伸数字

...

>>> addr.str.replace('.', '').str.extract(regex)

         city state         zip

0  Washington    DC       20003

1    Brooklyn    NY  11211-1755

2       Omaha    NE       68154

3  Pittsburgh    PA       15211

关于以上str对象的2个方法说明:

  • Series.str.replace:将Series中指定字符串替换
  • Series.str.extract:通过正则表达式提取字符串中的数据信息

这个用法就有点复杂了,因为很明显看到,这是一个链式的用法。通过replace将 " . " 替换为"",即为空,紧接着又使用了3个正则表达式(分别对应city,state,zip)通过extract对数据进行了提取,并由原来的Series数据结构变为了DataFrame数据结构。

当然,除了以上用法外,常用的属性和方法还有.rstrip.containssplit等,我们通过下面代码查看一下str属性的完整列表:

>>> [i for i in dir(pd.Series.str) if not i.startswith('_')]  

['capitalize',

 'cat',

 'center',

 'contains',

 'count',

 'decode',

 'encode',

 'endswith',

 'extract',

 'extractall',

 'find',

 'findall',

 'get',

 'get_dummies',

 'index',

 'isalnum',

 'isalpha',

 'isdecimal',

 'isdigit',

 'islower',

 'isnumeric',

 'isspace',

 'istitle',

 'isupper',

 'join',

 'len',

 'ljust',

 'lower',

 'lstrip',

 'match',

 'normalize',

 'pad',

 'partition',

 'repeat',

 'replace',

 'rfind',

 'rindex',

 'rjust',

 'rpartition',

 'rsplit',

 'rstrip',

 'slice',

 'slice_replace',

 'split',

 'startswith',

 'strip',

 'swapcase',

 'title',

 'translate',

 'upper',

 'wrap',

 'zfill']

属性有很多,对于具体的用法,如果感兴趣可以自己进行摸索练习。

dt对象的使用

Series数据类型:datetime

因为数据需要datetime类型,所以下面使用pandas的date_range()生成了一组日期datetime演示如何进行dt对象操作。

>>> daterng = pd.Series(pd.date_range('2017', periods=9, freq='Q'))  

>>> daterng

0   2017-03-31

1   2017-06-30

2   2017-09-30

3   2017-12-31

4   2018-03-31

5   2018-06-30

6   2018-09-30

7   2018-12-31

8   2019-03-31

dtype: datetime64[ns]

>>>  daterng.dt.day_name()

0      Friday

1      Friday

2    Saturday

3      Sunday

4    Saturday

5    Saturday

6      Sunday

7      Monday

8      Sunday

dtype: object

>>> # 查看下半年

>>> daterng\[daterng.dt.quarter > 2]

2   2017-09-30

3   2017-12-31

6   2018-09-30

7   2018-12-31

dtype: datetime64[ns]

>>> daterng[daterng.dt.is_year_end]

3   2017-12-31

7   2018-12-31

dtype: datetime64[ns]

以上关于dt的3种方法说明:

  • Series.dt.day_name():从日期判断出所处星期数
  • Series.dt.quarter:从日期判断所处季节
  • Series.dt.is_year_end:从日期判断是否处在年底

其它方法也都是基于datetime的一些变换,并通过变换来查看具体微观或者宏观日期。

cat对象的使用

Series数据类型:Category

在说cat对象的使用前,先说一下Category这个数据类型,它的作用很强大。虽然我们没有经常性的在内存中运行上g的数据,但是我们也总会遇到执行几行代码会等待很久的情况。使用Category数据的一个好处就是:可以很好的节省在时间和空间的消耗。下面我们通过几个实例来学习一下。

>>> colors = pd.Series([  

...     'periwinkle',

...     'mint green',

...     'burnt orange',

...     'periwinkle',

...     'burnt orange',

...     'rose',

...     'rose',

...     'mint green',

...     'rose',

...     'navy'

... ])

...

>>> import sys

>>> colors.apply(sys.getsizeof)

0    59

1    59

2    61

3    59

4    61

5    53

6    53

7    59

8    53

9    53

dtype: int64

上面我们通过使用sys.getsizeof来显示内存占用的情况,数字代表字节数。还有另一种计算内容占用的方法:memory\_usage(),后面会使用。

现在我们将上面colors的不重复值映射为一组整数,然后再看一下占用的内存。

>>> mapper = {v: k for k, v in enumerate(colors.unique())}  

>>> mapper

{'periwinkle': 0, 'mint green': 1, 'burnt orange': 2, 'rose': 3, 'navy': 4}

>>> as_int = colors.map(mapper)

>>> as_int

0    0

1    1

2    2

3    0

4    2

5    3

6    3

7    1

8    3

9    4

dtype: int64

>>> as_int.apply(sys.getsizeof)

0    24

1    28

2    28

3    24

4    28

5    28

6    28

7    28

8    28

9    28

dtype: int64

注:对于以上的整数值映射也可以使用更简单的pd.factorize()方法代替。

我们发现上面所占用的内存是使用object类型时的一半。其实,这种情况就类似于Category data类型内部的原理。

内存占用区别:Categorical所占用的内存与Categorical分类的数量和数据的长度成正比,相反,object所占用的内存则是一个常数乘以数据的长度。

下面是object内存使用和category内存使用的情况对比。

>>> colors.memory_usage(index=False, deep=True)  

650

>>> colors.astype('category').memory_usage(index=False, deep=True)

495

上面结果是使用objectCategory两种情况下内存的占用情况。我们发现效果并没有我们想象中的那么好。但是注意Category内存是成比例的,如果数据集的数据量很大,但不重复分类(unique)值很少的情况下,那么Category的内存占用可以节省达到10倍以上,比如下面数据量增大的情况:

>>> manycolors = colors.repeat(10)  

>>> len(manycolors)/manycolors.nunique() 

20.0

>>> manycolors.memory_usage(index=False, deep=True)

6500

>>> manycolors.astype('category').memory_usage(index=False, deep=True)

585

可以看到,在数据量增加10倍以后,使用Category所占内容节省了10倍以上。

除了占用内存节省外,另一个额外的好处是计算效率有了很大的提升。因为对于Category类型的Series,str字符的操作发生在.cat.categories的非重复值上,而并非原Series上的所有元素上。也就是说对于每个非重复值都只做一次操作,然后再向与非重复值同类的值映射过去。

对于Category的数据类型,可以使用accessor的cat对象,以及相应的属性和方法来操作Category数据。

>>> ccolors = colors.astype('category')  

>>> ccolors.cat.categories

Index(['burnt orange', 'mint green', 'navy', 'periwinkle', 'rose'], dtype='object')

实际上,对于开始的整数类型映射,可以先通过reorder_categories进行重新排序,然后再使用cat.codes来实现对整数的映射,来达到同样的效果。

>>> ccolors.cat.reorder_categories(mapper).cat.codes  

0    0

1    1

2    2

3    0

4    2

5    3

6    3

7    1

8    3

9    4

dtype: int8

dtype类型是Numpy的int8(-127~128)。可以看出以上只需要一个单字节就可以在内存中包含所有的值。我们开始的做法默认使用了int64类型,然而通过pandas的使用可以很智能的将Category数据类型变为最小的类型。

让我们来看一下cat还有什么其它的属性和方法可以使用。下面cat的这些属性基本都是关于查看和操作Category数据类型的。

>>> [i for i in dir(ccolors.cat) if not i.startswith('_')]  

['add_categories',

 'as_ordered',

 'as_unordered',

 'categories',

 'codes',

 'ordered',

 'remove_categories',

 'remove_unused\_categories',

 'rename_categories',

 'reorder_categories',

 'set_categories']

但是Category数据的使用不是很灵活。例如,插入一个之前没有的值,首先需要将这个值添加到.categories的容器中,然后再添加值。

>>> ccolors.iloc[5] = 'a new color'  

# ...

ValueError: Cannot setitem on a Categorical with a new category,

set the categories first

>>> ccolors = ccolors.cat.add\_categories(['a new color'])

>>> ccolors.iloc[5] = 'a new color'  

如果你想设置值或重塑数据,而非进行新的运算操作,那么Category类型不是那么有用。

二、从clipboard剪切板载入数据

当我们的数据存在excel表里,或者其它的IDE编辑器中的时候,我们想要通过pandas载入数据。我们通常的做法是先保存再载入,其实这样做起来十分繁琐。一个简单的方法就是使用pd.read\_clipboard() 直接从电脑的剪切板缓存区中提取数据。

这样我们就可以直接将结构数据转变为DataFrame或者Series了。excel表中数据是这样的:

在纯文本文件中,比如txt文件,是这样的:

a   b           c       d  

0   1           inf     1/1/00

2   7.389056099 N/A     5-Jan-13

4   54.59815003 nan     7/24/18

6   403.4287935 None    NaT

将上面excel或者txt中的数据选中然后复制,然后使用pandas的read_clipboard()即可完成到DataFrame的转换。parse_dates参数设置为"d",可以自动识别日期,并调整为xxxx-xx-xx的格式。

>>> df = pd.read_clipboard(na_values=[None], parse_dates=['d'])  

>>> df

   a         b    c          d

0  0    1.0000  inf 2000-01-01

1  2    7.3891  NaN 2013-01-05

2  4   54.5982  NaN 2018-07-24

3  6  403.4288  NaN        NaT

>>> df.dtypes

a             int64

b           float64

c           float64

d    datetime64[ns]

dtype: object

三、将pandas对象转换为“压缩”格式

在pandas中,我们可以直接将objects打包成为gzip, bz2, zip, or xz等压缩格式,而不必将没压缩的文件放在内存中然后进行转化。来看一个例子如何使用:

>>> abalone = pd.read_csv(url, usecols=[0, 1, 2, 3, 4, 8], names=cols)  

>>> abalone

     sex  length   diam  height  weight  rings

0      M   0.455  0.365   0.095  0.5140     15

1      M   0.350  0.265   0.090  0.2255      7

2      F   0.530  0.420   0.135  0.6770      9

3      M   0.440  0.365   0.125  0.5160     10

4      I   0.330  0.255   0.080  0.2050      7

5      I   0.425  0.300   0.095  0.3515      8

6      F   0.530  0.415   0.150  0.7775     20

...   ..     ...    ...     ...     ...    ...

4170   M   0.550  0.430   0.130  0.8395     10

4171   M   0.560  0.430   0.155  0.8675      8

4172   F   0.565  0.450   0.165  0.8870     11

4173   M   0.590  0.440   0.135  0.9660     10

4174   M   0.600  0.475   0.205  1.1760      9

4175   F   0.625  0.485   0.150  1.0945     10

4176   M   0.710  0.555   0.195  1.9485     12

导入文件,读取并存为abalone(DataFrame结构)。当我们要存为压缩的时候,简单的使用 to_json()即可轻松完成转化过程。下面通过设置相应参数将abalone存为了.gz格式的压缩文件。

abalone.to_json('df.json.gz', orient='records',  

                lines=True, compression='gzip')

如果我们想知道储存压缩文件的大小,可以通过内置模块os.path,使用getsize方法来查看文件的字节数。下面是两种格式储存文件的大小对比。

>>> import os.path  

>>> abalone.to_json('df.json', orient='records', lines=True)

>>> os.path.getsize('df.json') / os.path.getsize('df.json.gz')

11.603035760226396

四、使用"测试模块"制作伪数据

在pandas中,有一个测试模块可以帮助我们生成半真实(伪数据),并进行测试,它就是util.testing。下面同我们通过一个简单的例子看一下如何生成数据测试:

>>> import pandas.util.testing as tm  

>>> tm.N, tm.K = 15, 3  # 默认的行和列

>>> import numpy as np

>>> np.random.seed(444)

>>> tm.makeTimeDataFrame(freq='M').head()

                 A       B       C

2000-01-31  0.3574 -0.8804  0.2669

2000-02-29  0.3775  0.1526 -0.4803

2000-03-31  1.3823  0.2503  0.3008

2000-04-30  1.1755  0.0785 -0.1791

2000-05-31 -0.9393 -0.9039  1.1837

>>> tm.makeDataFrame().head()

                 A       B       C

nTLGGTiRHF -0.6228  0.6459  0.1251

WPBRn9jtsR -0.3187 -0.8091  1.1501

7B3wWfvuDA -1.9872 -1.0795  0.2987

yJ0BTjehH1  0.8802  0.7403 -1.2154

0luaYUYvy1 -0.9320  1.2912 -0.2907

上面简单的使用了

makeTimeDataFrame 和 makeDataFrame 分别生成了一组时间数据和DataFrame的数据。但这只是其中的两个用法,关于testing中的方法有大概30多个,如果你想全部了解,可以通过查看dir获得:

>>> [i for i in dir(tm) if i.startswith('make')]  

['makeBoolIndex',

 'makeCategoricalIndex',

 'makeCustomDataframe',

 'makeCustomIndex',

 # ...,

 'makeTimeSeries',

 'makeTimedeltaIndex',

 'makeUIntIndex',

 'makeUnicodeIndex']

五、从列项中创建DatetimeIndex

也许我们有的时候会遇到这样的情形(为了说明这种情情况,我使用了product进行交叉迭代的创建了一组关于时间的数据):

>>> from itertools import product  

>>> datecols = ['year', 'month', 'day']

>>> df = pd.DataFrame(list(product([2017, 2016], [1, 2], [1, 2, 3])),

...                   columns=datecols)

>>> df['data'] = np.random.randn(len(df))

>>> df

    year  month  day    data

0   2017      1    1 -0.0767

1   2017      1    2 -1.2798

2   2017      1    3  0.4032

3   2017      2    1  1.2377

4   2017      2    2 -0.2060

5   2017      2    3  0.6187

6   2016      1    1  2.3786

7   2016      1    2 -0.4730

8   2016      1    3 -2.1505

9   2016      2    1 -0.6340

10  2016      2    2  0.7964

11  2016      2    3  0.0005

明显看到,列项中有year,month,day,它们分别在各个列中,而并非是一个完整日期。那么如何从这些列中将它们组合在一起并设置为新的index呢?

通过to_datetime的使用,我们就可以直接将年月日组合为一个完整的日期,然后赋给索引。代码如下:

>>> df.index = pd.to_datetime(df[datecols])  

>>> df.head()

            year  month  day    data

2017-01-01  2017      1    1 -0.0767

2017-01-02  2017      1    2 -1.2798

2017-01-03  2017      1    3  0.4032

2017-02-01  2017      2    1  1.2377

2017-02-02  2017      2    2 -0.2060

当然,你可以选择将原有的年月日列移除,只保留data数据列,然后squeeze转换为Series结构。

>>> df = df.drop(datecols, axis=1).squeeze()  

>>> df.head()

2017-01-01   -0.0767

2017-01-02   -1.2798

2017-01-03    0.4032

2017-02-01    1.2377

2017-02-02   -0.2060

Name: data, dtype: float64

>>> df.index.dtype_str

'datetime64[ns]

以上是 pandas高级操作 的全部内容, 来源链接: utcz.com/a/15438.html

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