羊驼是羊还是驼（探究羊驼的历史故事）
首先，告诉你一个可以炫耀的知识点：羊驼是骆驼科的一员，而不是羊！
大家肯定会有疑问:不，骆驼背上不应该有山吗？为什么羊驼根本不像骆驼？
这必须从骆驼的祖先开始！
走着走着
骆驼科的祖先起源于大约5000万年前的北美。在第四纪冰期，由于海平面下降，一个穿过白令海峡，从北美到亚洲，进化成我们常见的双峰骆驼和非洲的单峰骆驼。
另一个，从北美南下，到达南美洲安第斯山地区，即南美骆驼的祖先——无峰骆驼。
骆驼科扩散之路（Burger et al., 2019）
其实南美只有四种无峰驼:原驼（Guanaco）、骆马（Vicuna）、美洲驼（Llama）还有我们熟悉的羊驼（Alpaca）。在这四种骆驼中，原骆驼和骆马是野生物种，而美国骆驼和羊驼是驯化物种（请记住这四个名字，因为它们会反复出现，很容易混淆）。
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但在这个时候，没有羊驼。
因为羊驼是驯化的物种，这意味着必须有人参与。
在最后一次从非洲出来后，人类逐渐蔓延到欧亚大陆。在最后一次冰盛时期（大约2万年前）之后，人类进一步从亚洲跨越了白令海峡和美洲。
这开始了人们驯化羊驼的故事。
人类走出非洲(图片来自网络)
那为什么人类会选择驯化羊驼，而不选一些其他的物种，比如猪啊、牛啊、羊啊这些。
首先，不是不想，是真的没有！
看看南美勤劳人民驯化的另外两个物种：火鸡 豚鼠。
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我们都知道火鸡是感恩节必备的食物，但像豚鼠这样天真无邪的动物在南美的主要功能就像火鸡一样:成为食物！
过去住在南美洲的人几乎家家户户都有豚鼠，每逢节日都会烤一只豚鼠招待客人(反正我也不会吃)。
前方高能预警！
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但随着时间的推移，你必须改变你的口味。此外，就自然适应性而言，人类非常依赖它。除了食物是由动物提供的，甚至衣服也必须是。例如，羊驼毛是各种纺织品的天然原料（从羊驼羊毛的外观中，我们可以知道羊毛有多足够，有几十种天然颜色）。
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因此，南美人民首先关注安第斯山上快乐奔跑的野生骆驼。
野生罗马(图片来自网络)
而且因为羊驼在南美，天敌很少。所以他们的性格也很温顺可爱。比如从来不咬人，因为没有门牙！
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最激烈的防御武器是远程射击，相对容易驯化。
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在这一点上，人类驯化动物就像男孩追女孩一样。任何一方过于敏感的人都不容易成功。例如，常年生活在竞争激烈的非洲草原上，即使是我们认为非常温顺的斑马也形成了一种性格（难怪到目前为止，非洲草原上还没有成功驯化的动物……）。
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但这些还不够！
人类除了吃穿依赖动物，还特别会计算成本。既让马儿跑，又让马儿吃得少，驯化动物也是，首先考虑找个只吃草，不吃肉的。羊驼就特别“争气”，完美地符合这一点！
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最后，这些各种因素加在一起，带有一点先天命运意义的羊驼诞生了(黑格尔:存在是合理的，现实中存在的一切都有自己的逻辑！
解开羊驼生活经历之谜
它看起来很合理，但还有一个问题：羊驼是从哪个野生物种驯化的？事实上，国际科学家一直不太清楚。有人说它来自原来的骆驼（Guanaco）、有人说是罗马（Vicuna），还有人说是原驼（Guanaco）和美洲驼（Llama）一起做的。
然而，不能怪科学家。……这些驼驼看起来像！(反正记得很可爱就对了)
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直到最近，在国际遗传学前沿杂志上，中国科学院动物研究所詹祥江实验室与国内外科学家合作 Genome Biology 发表研究论文，从基因组层面系统地解开了羊驼生活经历的谜团：你的父亲（祖先）是骆马（Vicuna）。但是！！历史上还有一个隔壁的王叔叔，那就是美洲驼（Llama）。
读到这里，我们不仅要问，科学家们是怎么知道的？
首先，科学家们在南美洲安第斯山广泛收集了这四种驼驼样品，即两种驯化物种(羊驼)Alpaca和美洲驼Llama），两个野生物种(原驼Guanaco和骆马Vicuna）。
图1 采样地图
拿到DNA序列结束后，我们做的第一件事就是用系统树来描述它们之间的进化关系。我们先把它记为A树。然而，这棵A树看起来有点奇怪：原始骆驼（Guanaco）和骆马(Vicuna)这两个野生物种已经分开很长时间了，这是可以理解的，毕竟是两个野生物种。
美洲驼（Llama）是原驼（Guanaco）后代，这也没什么争议，之前的研究也支持这个结论。
但是！羊驼比骆马好（Vicuna）的进化关系更久远，看着好像是骆马（Vicuna）它是从羊驼中驯化的。这在逻辑上是不合理的：野生物种如何成为驯化物种的后代？
图2 树木结构发生在系统中
因此，科学家们对遗传结构进行了分析，计算了每个人的祖先成分比例，以找出原因。
原来羊驼（Alpaca）的DNA成分里，有36%左右是从美洲驼（Llama）渗透很可能导致羊驼（Alpaca）和美洲驼（Llama）更靠近A树，让人觉得骆马（Vicuna）是从羊驼（Alpaca）驯化在里面的假象。
图3 遗传结构分析
然后，你会想，如果你渗透这些DNA切片都去掉了，正常吗？
科学家们也这么认为……
因此，科学家们通过局部祖先推断的操作进一步推断了这些DNA屏蔽片段后，发现正常！
图4 树构建(去除渗透片段后)发生在系统中
不仅如此，通过模型计算，科学家们发现美洲驼（Llama）大约36%的羊驼给了羊驼36%DNA，羊驼（Alpaca）还赠送了美洲驼（Llama）大约5%的DNA。这些大规模的礼尚往来造成了以往研究人员的不一致。
图5 进化关系示意图
所以，在知道了我是谁的问题后，科学家们有了一个新的问题：这种礼尚交流是什么时候发生的？它是怎么发生的？（有人强迫他们吗？
科学家们统计了这些问题的答案DNA通过构建一种叫做重组-衰减的统计模型，计算出礼尚往来最有可能发生的时间。
图6 推断渗透时间
结果发现，大约500年前，两次时间相对接近！也就是16世纪30年代。os：500年了，你还是发现了！
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500年前发生了什么？
翻开历史教科书，发现20世纪30年代是南美文明发展史上非常关键的时期，甚至改变了南美文明发展的轨迹！
16世纪以前，印加帝国一直统治着南美洲。印加帝国塑造了曾经辉煌的印加文明，与玛雅文明和阿斯特克文明并称为美国三大文明。
然而，随着哥伦布1492年发现美洲大陆，欧洲人开始了殖民扩张浪潮。西班牙人在20世纪30年代抵达南美洲。
两军相遇，必有一战。这场战争可以说是毫无悬念的。我们可以想象，面对枪支和铁骑加成，西班牙人甚至没有骑兵（回顾一下我们刚才说过的南美驯化的物种是什么？…）印第安人，几乎没有招架之力。西班牙人很容易征服南美洲，开启南美殖民时代。也可以看出动物驯化对人类社会文明的发展有多重要！
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西班牙人占领后，不仅屠杀了印第安人，而且动物也没有放手。研究人员通过对种群动态历史大小的推断，确实证实了当时羊驼数量的加速下降。
同时，羊驼（Alpaca）和美洲驼（Llama），西班牙人西班牙人也很困惑。这两只骆驼混合在一起。这种混乱的管理模式导致了上述广泛的基因渗透（礼尚交流）现象。
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虽然西班牙征服者的到来对当地传统的羊驼管理模式产生了巨大的影响，但令人欣慰的是，羊驼也从南美洲走向了世界！
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