熊猫:从行的特定列中选择值
给定一个包含多列的DataFrame,我们如何从特定列中逐行选择值来创建新的Series?熊猫:从行的特定列中选择值
df = pd.DataFrame({"A":[1,2,3,4], "B":[10,20,30,40],
"C":[100,200,300,400]})
columns_to_select = ["B", "A", "A", "C"]
目标: [10, 2, 3, 400]
一个方法,工作原理是利用一个适用的语句。
df["cols"] = columns_to_select df.apply(lambda x: x[x.cols], axis=1)
不幸的是,这不是一个矢量化操作,需要很长时间处理大型数据集。任何想法,将不胜感激。
回答:
Pandas approach:
In [22]: df['new'] = df.lookup(df.index, columns_to_select) In [23]: df
Out[23]:
A B C new
0 1 10 100 10
1 2 20 200 2
2 3 30 300 3
3 4 40 400 400
回答:
NumPy的方式
下面是使用advanced indexing
一个矢量NumPy的方式 -
# Extract array data In [10]: a = df.values
# Get integer based column IDs
In [11]: col_idx = np.searchsorted(df.columns, columns_to_select)
# Use NumPy's advanced indexing to extract relevant elem per row
In [12]: a[np.arange(len(col_idx)), col_idx]
Out[12]: array([ 10, 2, 3, 400])
如果df
列名不排序,我们需要使用sorter
大吵np.searchsorted
。该代码提取col_idx
,例如通用df
是:
# https://stackoverflow.com/a/38489403/ @Divakar def column_index(df, query_cols):
cols = df.columns.values
sidx = np.argsort(cols)
return sidx[np.searchsorted(cols,query_cols,sorter=sidx)]
所以,col_idx
会像这样获得 -
col_idx = column_index(df, columns_to_select)
进一步优化
剖析它揭示了瓶颈正在处理字符串np.searchsorted
,通常NumPy的弱点与字符串没有太大关系。所以,为了克服这个问题,并使用列名为单个字母的特殊情况,我们可以快速将它们转换为数字,然后将它们提供给searchsorted
以加快处理速度。
因此,获得基于整数列ID,对于列名的单字母排序的情况的优化版本,将是 -
def column_index_singlechar_sorted(df, query_cols): c0 = np.fromstring(''.join(df.columns), dtype=np.uint8)
c1 = np.fromstring(''.join(query_cols), dtype=np.uint8)
return np.searchsorted(c0, c1)
这给了我们解决方案的修改版,像这样 -
计时 -
In [149]: # Setup df with 26 uppercase column letters and many rows ...: import string
...: df = pd.DataFrame(np.random.randint(0,9,(1000000,26)))
...: s = list(string.uppercase[:df.shape[1]])
...: df.columns = s
...: idx = np.random.randint(0,df.shape[1],len(df))
...: columns_to_select = np.take(s, idx).tolist()
# With df.lookup from @MaxU's soln
In [150]: %timeit pd.Series(df.lookup(df.index, columns_to_select))
10 loops, best of 3: 76.7 ms per loop
# With proposed one from this soln
In [151]: %%timeit
...: a = df.values
...: col_idx = column_index_singlechar_sorted(df, columns_to_select)
...: out = pd.Series(a[np.arange(len(col_idx)), col_idx])
10 loops, best of 3: 59 ms per loop
鉴于df.lookup
解决了一般情况,这可能是一个更好的选择,但其他可能的优化,如这篇文章中所示,也可以很方便!
以上是 熊猫:从行的特定列中选择值 的全部内容, 来源链接: utcz.com/qa/267128.html