如何处理NULLS:C#,Microsoft SDS 1.3和NetCDF文件

我在写一个使用Microsoft Scientific Data Set读取NetCDF文件的C#程序。如何处理NULLS:C#,Microsoft SDS 1.3和NetCDF文件

using System; 

using System.IO;

using sds = Microsoft.Research.Science.Data;

using Microsoft.Research.Science.Data.Imperative;

namespace NetCDFConsoleApp

{

class Program

{

static void Main(string[] args)

{

// Gets dataset from file.

var dataset = sds.DataSet.Open("E:\\Temp\\test.nc?openMode=readOnly");

// Get the starting DateTime from the meta data.

string dt = (string)dataset.Metadata["START_DATE"];

//load dataset into array

Single[,,] dataValues = dataset.GetData<float[,,]>("ACPR");

//Get DateTime from Metadata fields.

DateTime dt2 = DateTime.ParseExact(dt, "yyyy-MM-dd_HH:mm:ss", null);

// Latitude grid ranges from = 0 to 215; East Cape is ~ 125-144

for (int iLatitude = 137; iLatitude < 138; iLatitude++)

{

//Longitude ranges from 0 to 165; East Cape is ~ 125-150

for (int iLongitude = 133; iLongitude < 134; iLongitude++)

{

//There is normally 85 hours worth of data in a file. But not always...

for (int iTime = 0; iTime < 65; iTime++)

{

// Get each data point

float? thisValue = dataValues[iTime,iLatitude,iLongitude];

//Burp it out to the Console. Increment the datetime while im at it.

Console.WriteLine(dt.ToString() + ',' + dt2.ToString() + ',' + iTime.ToString() + ',' + dt2.AddHours(iTime));

}

}

}

Console.ReadLine();

}

}

}

这些文件包含地图网格(X,Y)上的预测降雨量数据。每个网格参考应该有85小时的数据。

E:\temp>sds list test.nc 

[2] ACPR of type Single (Time:85) (south_north:213) (west_east:165)

[1] Times of type SByte (Time:85) (DateStrLen:19)

但是偶尔他们可能会少一些(说60-70小时)。当这种情况发生时,我的C#程序在导入数据时失败。

var dataset = sds.DataSet.Open("test.nc?openMode=readOnly"); 

Single[,,] dataValues = dataset.GetData<Single[,,]>("ACPR");

我可以用命令行重现错误。

在这里,我可以成功地提取网格XY:125,130小时60-65。我在这个文件中的最后一个值是Time = 69。

E:\temp>sds data test.nc ACPR[60:65,125:125,130:130] 

[2] ACPR of type Single (Time:85) (south_north:213) (west_east:165)

Name = ACPR

description = ACCUMULATED TOTAL GRID SCALE PRECIPITATION

MemoryOrder = XY

coordinates = XLONG XLAT XTIME

stagger =

FieldType = 104

units = mm

[60,125,130] 13.4926

[61,125,130] 15.24556

[62,125,130] 16.3638

[63,125,130] 17.39618

[64,125,130] 20.00507

[65,125,130] 23.57192

如果我尝试阅读过去的小时数69,我得到以下错误。

E:\temp>sds data test.nc ACPR[60:70,125:125,130:130] 

[2] ACPR of type Single (Time:85) (south_north:213) (west_east:165)

Name = ACPR

description = ACCUMULATED TOTAL GRID SCALE PRECIPITATION

MemoryOrder = XY

coordinates = XLONG XLAT XTIME

stagger =

FieldType = 104

units = mm

Unhandled Exception: System.AccessViolationException: Attempted to read or write protected memory. This is often an indication that other memory is corrupt.

at nc_get_vara_float(Int32 , Int32 , UInt64* , UInt64* , Single*)

at NetCDFInterop.NetCDF.nc_get_vara_float(Int32 ncid, Int32 varid, IntPtr[] start, IntPtr[] count, Single[] data)

at Microsoft.Research.Science.Data.NetCDF4.NetCdfVariable`1.ReadData(Int32[] origin, Int32[] shape)

at sdsutil.Program.PrintData(Variable v, String range, String format)

at sdsutil.Program.DoData(String uri, String[] args)

at sdsutil.Program.Main(String[] args)

E:\temp>

如果该文件包含了完整的85小时内,我可以请求时间0-100,它仍然给了我85个值没有错误。

我相信那个问题是NULL /丢失的数据。有什么方法可以在导入变量不为空的数据时指定?或者使用一些try/catch?

Single[,,] dataValues = dataset.GetData<Single[,,]>("ACPR")>> where it's not blank thanks. ; 

编辑:我开始怀疑文件形成不正确。使用SDS浏览器一个好文件的元数据与这样的糟糕的外观;

然而,命令行显示元数据作为两个相同的。

E:\temp>sds good.nc 

[2] ACPR of type Single (Time:85) (south_north:213) (west_east:165)

[1] Times of type SByte (Time:85) (DateStrLen:19)

E:\temp>sds bad.nc

[2] ACPR of type Single (Time:85) (south_north:213) (west_east:165)

[1] Times of type SByte (Time:85) (DateStrLen:19)

E:\temp>

回答:

彼得,

由于误差在READDATA(的Int32 []原点,的Int32 []形状)(您指出相同);我看到两种可能的解决方案:

在深入研究解决方案之前,您需要确定缺失数据是否可以视为0.0或需要将其视为缺失。如果缺失与0.0不同,那么如果null不可接受,潜在缺失可以编码为-1.0。对于缺失的数据提出-1.0的值,假定负的降雨量值是不可能的。

如果结果dataValues包含空值,您可能需要做的所有操作都是用浮点数替换浮点数?在该行:

float thisValue = dataValues[iTime,iLatitude,iLongitude]; 

是:

float? thisValue = dataValues[iTime,iLatitude,iLongitude]; 

如果你是家庭免费提供float?那么这是一个快乐的解决方案。 (您仍然需要决定如何处理空值。)

否则可能的解决方案1)

后,调用Single[,,] dataValues = dataset.GetData<Single[,,]>("ACPR");确保该阵列,dataValues的最后一个索引的大小,是85潜在的GetData(..)不填充所有85场,尤其是如果第一行数据包含少于85个字段。然后,如果需要,用0或-1.0手动替换空值。

然后,当您检索数据,你处理空值,0或-1.0适当:

float? thisValue = dataValues[iTime,iLatitude,iLongitude]; 

// determine what to do with a null/0.0/-1.0 as a thisValue[..] value,

// .. potentially continue with the next iteration

可能的解决方法2)

如果您拥有Single[,,] dataValues = dataset.GetData<Single[,,]>("ACPR");中的GetData(..)方法,那么你确保它提供全部85个值和缺失值的工作是否为零/ 0/-1.0。然后,当您检索数据时,您会适当地处理零值,0或-1.0。

干杯,

阿维

回答:

我推荐你试试这个,因为你不知道的数据类型它试图返回:

Object[,,] dataValues = dataset.GetData<object[,,]>("ACPR"); 

然后你就可以检查是否有一个有效的漂浮在循环中。

if (dataValues[iTime,iLatitude,iLongitude] == null) 

{

float floatValue = 0;

if (Single.TryParse(dataValues[iTime,iLatitude,iLongitude].ToString(), out floatValue)

{

Console.WriteLine(dt.ToString() + ',' + dt2.ToString() + ',' + iTime.ToString() + ',' + dt2.AddHours(iTime));

}

}

以上是 如何处理NULLS:C#,Microsoft SDS 1.3和NetCDF文件 的全部内容, 来源链接: utcz.com/qa/260516.html

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