如何计算R的土地覆盖面积
基本上,我用ASCII的形式计算了一个全局分布概率模型,例如: gdpm
。 gdpm
的值全部为0和1之间如何计算R的土地覆盖面积
然后我输入从形状文件的本地地图:
shape <- file.choose() map <- readOGR(shape, basename(file_path_sans_ext(shape)))
下一步,我光栅化gdpm
,并裁剪使用本地地图:
ldpm <- mask(gdpm, map)
然后,我重新分类该连续模型转换为离散的模型(I划分模型6层):
recalc <- matrix(c(0, 0.05, 0, 0.05, 0.2, 1, 0.2, 0.4, 2, 0.4, 0.6, 3, 0.6, 0.8, 4, 0.8, 1, 5), ncol = 3, byrow = TRUE) ldpmR <- reclassify(ldpm, recalc)
我已经有了一个裁剪和重新分类的栅格,现在我需要总结土地覆盖,也就是说,每个级别,我想计算的本地地图的每个区域的面积比例。(我不知道如何用术语来描述它)。我发现,跟着一个例子(RobertH):
ext <- raster::extract(ldpmR, map) tab <- sapply(ext, function(x) tabulate(x, 10))
tab <- tab/colSums(tab)
但我不知道是否可行,因为tab
输出是混乱的。 那么如何正确计算土地覆盖面积呢?我如何在每个多边形内应用正确的方法?
我的原始数据是太大,我只能提供替代光栅(我认为这个例子应该适用不同的重新分类矩阵):
Example raster
或者你可以生成测试光栅(RobertH ):
library(raster) s <- stack(system.file("external/rlogo.grd", package="raster"))
writeRaster(s, file='testtif', format='GTiff', bylayer=T, overwrite=T)
f <- list.files(pattern="testtif_..tif")
我也有一个关于绘制光栅问题:
r <- as(r, "SpatialPixelsDataFrame") r <- as.data.frame(r)
colnames(r) <- c("value", "x", "y")
我做了这个转换,使光栅绘图 - 与ggplot2能够,有没有一个更简洁的方法?
回答:
好像你可以通过像素数获得面积。
让我们先从一个可重复的例子:
r <- raster(system.file("external/test.grd", package="raster")) plot(r)
由于在此栅格中值的另一范围比你的数据,让他们适应自己的价值观:
r <- r/1000 r[r>1,] <- 1
之后,我们将申请您的重新分类:
recalc <- matrix(c(0, 0.05, 0, 0.05, 0.2, 1, 0.2, 0.4, 2, 0.4, 0.6, 3, 0.6, 0.8, 4, 0.8, 1, 5), ncol = 3, byrow = TRUE) r2 <- reclassify(r, recalc)
plot(r2)
现在,我们如何得到该地区?
由于您正在使用投影栅格,因此您可以简单地使用像素数和栅格分辨率。因此,我们首先需要检查的分辨率和投影的地图单位:
res(r) # [1] 40 40
crs(r)
# CRS arguments:
# +init=epsg:28992
# +towgs84=565.237,50.0087,465.658,-0.406857,0.350733,-1.87035,4.0812 +proj=sterea
# +lat_0=52.15616055555555 +lon_0=5.38763888888889 +k=0.9999079 +x_0=155000
# +y_0=463000 +ellps=bessel +units=m +no_defs
现在,我们知道,我们所面对的是40×40米的像素,因为我们有一个指标CRS。
让我们用这些信息来计算每个类的面积。
app <- res(r)[1] * res(r)[2] # area per pixel table(r2[]) * app
# 1 2 3 4 5
# 124800 2800000 1310400 486400 243200
对于地理参考栅格的绘制,我想请您看看an older question here on SO
回答:
Loki的答案是确定的,但是这是可以做到的光栅方式,这是更安全的。和它考虑坐标是否角(经度/纬度)或平面(投影)
实施例数据
library(raster) r <- raster(system.file("external/test.grd", package="raster"))
r <- r/1000
recalc <- matrix(c(0, 0.05, 0, 0.05, 0.2, 1, 0.2, 0.4, 2, 0.4, 0.6, 3, 0.6, 0.8, 4, 0.8, 2, 5), ncol = 3, byrow = TRUE)
r2 <- reclassify(r, recalc)
方法1.仅用于平面数据
f <- freq(r2, useNA='no') apc <- prod(res(r))
f <- cbind(f, area=f[,2] * apc)
f
# value count area
#[1,] 1 78 124800
#[2,] 2 1750 2800000
#[3,] 3 819 1310400
#[4,] 4 304 486400
#[5,] 5 152 243200
方法2是重要。对于角度数据(但也适用于平面数据)
a <- area(r2) z <- zonal(a, r2, 'sum')
z
# zone sum
#[1,] 1 124800
#[2,] 2 2800000
#[3,] 3 1310400
#[4,] 4 486400
#[5,] 5 243200
如果要总结e。通过多边形,你可以做这样的事情:
# example polygons a <- rasterToPolygons(aggregate(r, 25))
方法1
# extract values (slow) ext <- extract(r2, a)
# tabulate values for each polygon
tab <- sapply(ext, function(x) tabulate(x, 5))
# adjust for area (planar data only)
tab <- tab * prod(res(r2))
# check the results, by summing over the regions
rowSums(tab)
#[1] 124800 2800000 1310400 486400 243200
方法2
x <- rasterize(a, r2) z <- crosstab(x, r2)
z <- cbind(z, area = z[,3] * prod(res(r2)))
检查结果:
aggregate(z[, 'area', drop=F], z[,'Var2', drop=F], sum) Var2 area
#1 1 124800
#2 2 2800000
#3 3 1310400
#4 4 486400
#5 5 243200
请注意,如果您正在处理您可以输入的lon/lat数据不使用prod(res(r))来获取单元大小。在这种情况下,你会需要使用区域函数并遍历类,我想。
您还问过关于绘图。绘制栅格*对象的方法很多。基本的是:
image(r2) plot(r2)
spplot(r2)
library(rasterVis);
levelplot(r2)
更靠谱的办法:
library(ggplot2) # using a rasterVis method theme_set(theme_bw())
gplot(r2) + geom_tile(aes(fill = value)) +
facet_wrap(~ variable) +
scale_fill_gradient(low = 'white', high = 'blue') +
coord_equal()
library(leaflet)
leaflet() %>% addTiles() %>%
addRasterImage(r2, colors = "Spectral", opacity = 0.8)
以上是 如何计算R的土地覆盖面积 的全部内容, 来源链接: utcz.com/qa/260200.html