RCPP功能不能由R

  • Z时代
  • 2024-01-10
  • 分类：问答

找到我建立一个Rpackage（称为myUtils），它使用一个文件cpp，在RStudio以下Hadley's manual。我cpp文件驻留在src目录，运行后创建：devtools::use_rcpp()，我R目录下我有一个名为myUtils.R文件，用这些行：RCPP功能不能由R

#' myUtils: A package with various functions for my analyses 
#' 
#' 
#' @docType package 
#' @name myUtils 
#' @useDynLib myUtils 
#' @importFrom Rcpp sourceCpp 
NULL

这是我的cpp文件：

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo, RcppEigen)]] 
#include <RcppArmadillo.h> 
#include <RcppEigen.h> 
using namespace Rcpp; 
// [[Rcpp::export]] 
SEXP armaMatMult(arma::mat A, arma::mat B){ 
    arma::mat C = A * B; 
    return Rcpp::wrap(C); 
} 
// [[Rcpp::export]] 
SEXP eigenMatMult(Eigen::MatrixXd A, Eigen::MatrixXd B){ 
    Eigen::MatrixXd C = A * B; 
    return Rcpp::wrap(C); 
}

然后我跑devtools::document()里面添加useDynLib(myUtils)到NAMESPACE文件。然后我跑Build & Reload，其中成功完成，并创建了RccpExports.R文件中R目录，在它与cpp功能，例如：

eigenMatMult <- function(A, B) { 
    .Call('_myUtils_eigenMatMult', PACKAGE = 'myUtils', A, B) 
}

然后我试图测试eigenMatMult，但它不认可：

set.seed(1) 
A <- matrix(rnorm(100), 10, 10) 
> eigenMatMult(A=A,B=A) 
Error: could not find function "eigenMatMult"

和既不myUtils::

之前，当出现看起来像我失去了一些东西，但我无法弄清楚它是什么。

帮助将不胜感激。

回答：

的RCPP属性机制在NAMESPACE文件本身不添加函数的出口指令。我们的示例使用通配符导出所有内容。

所以，如果你的函数是不可见的，做

  • 通话的一方或双方通过:::即myUtils:::eigenMatMult(A, A)

  • 添加eigenMatMult出口，手工或通过roxygen标签

以上是 RCPP功能不能由R 的全部内容， 来源链接： utcz.com/qa/258505.html

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