如何使用awk压缩文件

• Z时代
• 2024-01-10
• 分类：问答

如何更改压缩文件的以下命令？

awk 'FNR==NR { array[$1,$2]=$8; next } ($1,$2) in array { print $0 ";" array[$1,$2] }' input1.vcf input2.vcf

该命令可以正常使用正常文件。我需要更改压缩文件的命令。

回答：

您需要像这样读取它们的压缩文件：

awk '{ ... }' <(gzip -dc input1.vcf.gz) <(gzip -dc input2.vcf.gz)

尝试这个：

awk 'FNR==NR { sub(/AA=\.;/,""); array[$1,$2]=$8; next } ($1,$2) in array { print $0 ";" array[$1,$2] }' <(gzip -dc input1.vcf.gz) <(gzip -dc input2.vcf.gz) | gzip > output.vcf.gz

以上是 如何使用awk压缩文件 的全部内容， 来源链接： utcz.com/qa/418511.html