奇怪的回声行为瓦尔

我有我希望能转换成一个for循环下面简单的代码:奇怪的回声行为瓦尔

i="1"; \ 

plate="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 2)"; \

plateid="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 3)"; \

strain="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 4)"; \

replicate="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 5)"; \

timepoint="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 6)"; \

medium="$(grep -P "^${i}" SampleIDs-Nov9-gyrA_S1-2.tab | cut -f 7)"; \

total="$(awk -F'\t' 'BEGIN{n=0}{ n++ }END{print n/4}' ../trial1_merged_dir/${i}.extendedFrags.fastq)"; \

mut="$(grep -P "^${strain}" mutants-short.unix.txt | awk '{print toupper($2)}')"; \

wt="$(grep -P "^${strain}" mutants-short.unix.txt | awk '{print toupper($3)}')"; \

mutc="$(grep -c $mut ../trial1_merged_dir/${i}.extendedFrags.fastq)"; \

wtc="$(grep -c $wt ../trial1_merged_dir/${i}.extendedFrags.fastq)"; \

echo $i; \

echo $strain; \

echo $medium; \

echo $replicate; \

echo $timepoint; \

echo $wtc; \

echo $mutc; \

echo $total; \

输出:

1 

cip1

M9_Glucose

1

T0

4794

2938

9289

这是正常的。然而,当我与一个取代最后8行回声:

echo "$strain $i $medium $replicate $timepoint $wtc $mutc $total"; \ 

输出:

1 T0 4794 2938 9289 

不正常。我想知道有什么可能导致一些价值观的药房?

还有一次,我尝试了,我得到这个输出:

1 1ip1 T0_Gluco4794 2938 9289 

更为离奇的是一些文本融合,结果被截断。

回答:

$medium最后有一个CR。在提取变量后将其删除,或使用dos2unix对文件进行预处理。

以上是 奇怪的回声行为瓦尔 的全部内容, 来源链接: utcz.com/qa/258138.html

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